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アプリ 1.11.1 では、バリエーションをアーカイブ・削除した操作が、変更履歴に文で残ります。
アイテムの変更履歴に、バリエーションのアーカイブ・削除が文で出ます。「過去のバリエーション」への移動と、そこから戻した操作も残ります。Web 版と同じ言い方です。
アプリを 1.11.1 にすると使えます。